MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021030	GACT	2	8	866718	866725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_021030	GCA	2	6	866749	866754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021030	GAC	2	6	866777	866782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_021030	AC	3	6	866781	866786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_021030	TGT	2	6	866938	866943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021030	TGCA	2	8	866946	866953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_021030	TGCTC	2	10	866975	866984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5508	NC_021030	TGG	2	6	866987	866992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021030	ATG	2	6	867034	867039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021030	GTT	2	6	867103	867108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021030	ACC	2	6	867179	867184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_021030	CTG	2	6	867312	867317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021030	AGC	2	6	867373	867378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021030	CCGA	2	8	867382	867389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_021030	CCT	2	6	867512	867517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_021030	GCG	2	6	867585	867590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_021030	CCA	2	6	867635	867640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_021030	TGC	2	6	867666	867671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_021030	CTC	2	6	867717	867722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_021030	AAC	2	6	877048	877053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021030	CT	3	6	877065	877070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_021030	TAA	2	6	877096	877101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021030	TCC	2	6	877268	877273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_021030	TCA	2	6	877274	877279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_021030	GGT	2	6	877295	877300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021030	GA	3	6	877316	877321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021030	TAA	2	6	877334	877339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021030	TAAAAC	2	12	877341	877352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5529	NC_021030	AAC	3	9	877508	877516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021030	AAC	2	6	877535	877540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_021030	ATT	2	6	877545	877550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021030	GTA	2	6	877625	877630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021030	TGG	2	6	877757	877762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021030	AG	3	6	877778	877783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021030	CT	3	6	877798	877803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_021030	GTTT	2	8	877836	877843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021030	T	8	8	881275	881282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021030	GCA	2	6	881351	881356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_021030	TGG	2	6	881373	881378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021030	GGT	2	6	881499	881504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021030	ATGG	2	8	881506	881513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021030	TGGT	2	8	881531	881538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021030	C	6	6	881589	881594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5544	NC_021030	GCA	2	6	881633	881638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021030	CAG	2	6	881796	881801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_021030	GGA	2	6	881814	881819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021030	AG	3	6	881930	881935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021030	GAT	2	6	882095	882100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021030	CGG	2	6	882125	882130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_021030	AAGCGA	2	12	882133	882144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5551	NC_021030	GGA	2	6	882215	882220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021030	GAT	2	6	882237	882242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021030	TGC	2	6	882321	882326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_021030	GTC	2	6	882333	882338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_021030	AC	3	6	882498	882503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_021030	GGTA	2	8	882514	882521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021030	TCGGA	2	10	882574	882583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_021030	AC	3	6	882667	882672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_021030	CCT	2	6	882799	882804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_021030	N	463	463	882813	883275	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_021030	GAGAT	2	10	883299	883308	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021030	TG	3	6	883332	883337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021030	GAA	2	6	883394	883399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021030	AGA	2	6	883483	883488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021030	CTGAA	2	10	883518	883527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5566	NC_021030	TAG	2	6	883534	883539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_021030	GAG	2	6	883540	883545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021030	AGAA	2	8	883550	883557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_021030	GCG	2	6	883576	883581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_021030	ACC	2	6	883782	883787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_021030	AGC	2	6	883908	883913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021030	AAT	2	6	883940	883945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021030	AAGCGA	2	12	884001	884012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5574	NC_021030	GGC	2	6	884023	884028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_021030	GGA	2	6	884100	884105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021030	CGAA	2	8	884107	884114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_021030	AGT	2	6	884301	884306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021030	CAG	2	6	884315	884320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_021030	AAC	2	6	884358	884363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_021030	TGC	2	6	884418	884423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_021030	AGC	2	6	884450	884455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_021030	ATTC	2	8	884457	884464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_021030	ATA	2	6	884507	884512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021030	ACC	2	6	884529	884534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_021030	GA	3	6	884792	884797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021030	CGC	2	6	884815	884820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_021030	GGT	2	6	884832	884837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021030	TCT	2	6	884948	884953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_021030	CCGTA	2	10	884973	884982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5590	NC_021030	GGT	2	6	884993	884998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021030	GAG	2	6	885000	885005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021030	AGA	2	6	885155	885160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021030	CGG	2	6	885247	885252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_021030	TGA	2	6	885373	885378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021030	TGG	2	6	885566	885571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021030	GGT	2	6	885585	885590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021030	GGT	2	6	885729	885734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021030	TG	3	6	885737	885742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021030	CGC	2	6	885794	885799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_021030	CGG	2	6	885818	885823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_021030	CGT	2	6	885924	885929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_021030	TGC	2	6	886031	886036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_021030	CCG	2	6	886045	886050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_021030	ACT	2	6	886139	886144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_021030	T	6	6	886212	886217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021030	GCA	2	6	886218	886223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_021030	TGA	2	6	886277	886282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021030	AT	3	6	886310	886315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021030	GGT	2	6	886335	886340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021030	GTAG	2	8	886429	886436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021030	T	8	8	886471	886478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021030	AGG	2	6	886499	886504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021030	G	9	9	886520	886528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021030	GTA	2	6	886609	886614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021030	A	6	6	886634	886639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021030	CAA	2	6	886671	886676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_021030	TG	3	6	886703	886708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021030	TTTCCC	2	12	886747	886758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_021030	GAA	2	6	886806	886811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021030	A	6	6	886810	886815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021030	T	6	6	886823	886828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_021030	T	6	6	886837	886842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021030	ACC	2	6	886867	886872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_021030	TCT	2	6	886910	886915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_021030	CTC	2	6	886920	886925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_021030	GAT	2	6	887738	887743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021030	TTA	2	6	887750	887755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021030	ATA	2	6	890650	890655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_021030	C	9	9	890664	890672	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5630	NC_021030	A	9	9	890673	890681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021030	AGGC	2	8	890684	890691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5632	NC_021030	CCT	2	6	890704	890709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_021030	A	6	6	895445	895450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5635	NC_021030	AAATGA	2	12	898306	898317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5905	NC_021030	TCG	2	6	931306	931311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5937	NC_021030	T	6	6	933807	933812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5996	NC_021030	GC	3	6	960548	960553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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